在现代社会中，并存着人类和口袋妖怪。口袋妖怪们平时可以被缩小收入一个叫做精灵球的球内，被训练师带在身上或放在口袋中，口袋妖怪所以呢得名。人类与它们和谐相处，并且有许多和口袋妖怪有关的职业，像培育师，训练师等。故事的主角是一名口袋妖怪训练师，···